Các sân bay tại Bồ Đào Nha đã đưa ra cảnh báo về khả năng hành khách phải xếp hàng chờ đợi lên đến hai giờ khi hệ thống kiểm soát biên giới Nhập cảnh/Xuất cảnh (EES) được triển khai. Những lo ngại này xuất hiện sau một tuyên bố chung do Hiệp hội sân bay châu Âu ACI Europe và Hiệp hội ngành hàng không A4E đưa ra vào ngày 30-31 tháng 3 năm 2026, nhấn mạnh những thách thức vận hành do các yêu cầu sinh trắc học mới đặt ra www.theportugalnews.comwww.aci-europe.org.

Trong khi các cơ quan trong ngành bày tỏ lo ngại rộng rãi về việc triển khai trên khắp EU, các cảnh báo cụ thể về sự chậm trễ đáng kể đã được báo cáo rõ rệt nhất tại các trung tâm trung chuyển của Bồ Đào Nha.

Các quốc gia thành viên khác, bao gồm Pháp, Bỉ và Hà Lan, cũng đã báo cáo các mức độ gián đoạn khác nhau hoặc điều chỉnh lịch trình triển khai sinh trắc học khi hệ thống đi vào hoạt động www.connexionfrance.comwww.frenchentree.comwww.visahq.com.